在选购玛瑙时，应从其颜色、透明度、结构质和硬度这四个部分来进行辨别。真玛瑙的色泽鲜润具活性感、纯正、厚重、协调；而假玛瑙的色和光都不自然，往往艳丽轻浮。而有的有年份成品物，可能出自酸碱度较高的老坑，通常光泽减少，色度减少，透明度减少，当然，因其表面老化斑驳的贵重美感而改变身份。

真玛瑙透明度不高，有的能看见自然水线或云彩、丝絮。而人工合成的玛瑙透明度好，甚至像玻璃球一样透明，往往不自然。假玛瑙是用其他石料仿制，特别是其料易碎或轻软。通常，玛瑙比较结实，多数非酸碱影响的玛瑙利茬可在玻璃板上可划出划痕来。真玛瑙首饰比人工合成的玛瑙首饰重一些。

天然玛瑙和假冒产品的最显著的区别，就是横断面有没有同心层纹结构。然而，整块玛瑙较为容易识别，而经切割后的制成品，没有明显整齐的图案，容易认错。但一般来说，天然玛瑙手感凉，表面像涂了一层蜡，并有蜡的光泽，呈半透明。

硬度在莫氏7级以上，用小刀刻不动；由于它是在溶融状态下形成的结晶体，多为球状（如雨花石），特别致密，表面研磨后更为细腻，可在硬杂木板上急骤地摩擦十几下，一般真玛瑙不热，木板却发烫。颜色常是多种色彩混杂于一块玛瑙中，形成美丽的花纹、层纹、锦花等绚丽多彩的图案。