绿松石天然的通常都是会有瑕疵的。绿松石是一种由水、铜和铝的磷酸盐组合而成的矿物。绿松石由于产地不同，所含的化学成分也会不同，形成的结构也就各异，有的呈透明的晶体，有的呈致密的块状，有的呈球形、椭圆形、葡萄形等，可谓千姿百态。绿松石的结构形态属于三斜晶系，即地质学上所说的该矿物既没有对称轴，也没有对称面，形态极不规则。

绿松石质地不很均匀，颜色有深有浅，甚至含浅色条纹、斑点以及褐黑色的铁线。致密程度也有较大差别，孔隙多者疏松，少则致密坚硬。抛光后具柔和的玻璃光泽至蜡状光泽。优质品经抛光后好似上了釉的瓷器，故称谓瓷松石。绿松石也有缺点，那就是绿松石受热易褪色，也容易受强酸腐蚀变色。此外硬度越低的绿松石孔隙越发育，越具有吸水性和易碎的缺陷，因而油渍、污渍、汗渍、化妆品、茶水、铁锈等均有可能顺孔隙进入，导致难以去除的色变，所以镶嵌使用的绿松石一般都会封蜡处理。

毕竟无暇不成玉，绿松石作为自然产物有瑕疵是很正常的。像是绿松石在形成以及开采、打磨过程中，都有可能形成裂纹，尤其是一些瓷度高的绿松石。一些不明显的裂纹，通过后期盘玩，是能够弥补的。而那些已经有明显裂痕，用手能够摸到，并且影响绿松石的品质的，大家就要谨慎购买了。